Семинар начал функционировать в 1956 году в Вычислительном центре МГУ. Первыми участниками семинара были С.Л. Соболев, М.Р. Шура-Бура, И.С. Березин, К.А. Семендяев, Н.П. Брусенцов, Н.П. Трифонов, Е.А. Жоголев и сотрудники Вычислительного центра МГУ. На первых заседаниях обсуждались вопросы построения троичного компьютера "Сетунь". В дальнейшем на этом семинаре стали регулярно обсуждаться разнообразные вопросы автоматизации программирования, а его постоянным научным руководителем стал профессор М.Р. Шура-Бура.

Начиная с 60-х годов, семинар сделался одним из ведущих научных форумов нашей страны. На нем выступали многие ведущие системные программисты бывшего СССР: Ю.И. Янов, А.П. Ершов, С.С. Лавров, В.Ф. Турчин, Н.Н. Говорун, Э.Х. Тыугу, И.В. Вельбицкий, В.Е. Котов, Н.Н. Миренков, С.А. Абрамов, Ф.И. Андон, А.С. Клещев, В.П. Кутепов, С.М. Абрамов, Р.И. Подловченко, А.Я. Диковский, М.И. Канович, М.Г. Мальковский, В.Ш. Кауфман, Р.М. Нуриев, В.А. Серебряков, Б.А. Бабаян, Р.Л. Смелянский и другие.